RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447577.5

CCDC18-AS1-216, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 431 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 Q6ZNB5 142 aa6.62□□□□□ -1.35
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CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BICD2Q8TD16 824 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.61□□□□□ -1.35
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CCDC18-AS1-216ENST00000447577 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 65.2
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
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CCDC18-AS1-216ENST00000447577 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCDC169A6NNP5 214 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C19orf84I3L1E1 186 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MDM4O15151 490 aa6.6□□□□□ -1.35
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CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZBTB43O43298 467 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AQP9O43315 295 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GCATO75600 419 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TOM1L1O75674 476 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KLKB1P03952 638 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TCN2P20062 427 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 F8A1P23610 371 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ANXA13P27216 316 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HTR1EP28566 365 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HLA-FP30511 346 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NOS2P35228 1153 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DRD3P35462 400 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NPTX2P47972 431 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PEX3P56589 373 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CDK18Q07002 472 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MCL1Q07820 350 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ART3Q13508 389 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FZD2Q14332 565 aa6.6□□□□□ -1.35
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