RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 TRIM58Q8NG06 486 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM71BQ8TC56 605 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 EXOC4Q96A65 974 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 KCND1Q9NSA2 647 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 FBXL21Q9UKT6 434 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC22A23-201ENST00000380298 COL4A2P08572 1712 aa28.39■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 F5P12259 2224 aa28.39■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CREB3O43889 395 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CLDN11O75508 207 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 HOXC13P31276 330 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CTHP32929 405 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 HCAR3P49019 387 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CDH4P55283 916 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 PRKCQQ04759 706 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 PDK2Q15119 407 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 STIM2Q9P246 746 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 FBXO10Q9UK96 956 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CDH6P55285 790 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 KCTD6Q8NC69 237 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 PCDH18Q9HCL0 1135 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ARHGEF3Q9NR81 526 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC66A2RUB6 948 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 MAN2B1O00754 1011 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 DCXO43602 365 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 TNNT1P13805 278 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 EPHB2P29323 1055 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ARL4AP40617 200 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 SOX9P48436 509 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ARSEP51690 589 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 TPI1P60174 286 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 KRT81Q14533 505 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CHFRQ96EP1 664 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 SHDQ96IW2 340 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 H3BRJ5 948 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 RHOQP17081 205 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CTNNA2P26232 953 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 OPRD1P41143 372 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ALFQ53S48 1182 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 IER5LQ5T953 404 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 MFN1Q8IWA4 741 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 NAT16Q8N8M0 369 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 DONSONQ9NYP3 566 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 MPP6Q9NZW5 540 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 DEC1Q9P2X7 70 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 NEU3Q9UQ49 428 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 TULP3O75386 442 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CNTN5O94779 1100 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ALADP13716 330 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 IRAK1P51617 712 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CDH18Q13634 790 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ODF2Q5BJF6 829 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 RFX8Q6ZV50 586 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 C12orf40Q86WS4 652 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 VSIG1Q86XK7 387 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 KATNAL2Q8IYT4 538 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 FIBINQ8TAL6 211 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 EDAQ92838 391 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CA14Q9ULX7 337 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 USP27XA6NNY8 438 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 H0Y626 953 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 FTCDO95954 541 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 GOT1P17174 413 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 KDELR1P24390 212 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 OXCT1P55809 520 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 TPRG1Q6ZUI0 275 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 CARNMT1Q8N4J0 409 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 TSC1Q92574 1164 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 P2RY13Q9BPV8 354 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF670Q9BS34 389 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 TMEM248Q9NWD8 314 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 COL4A3Q01955 1670 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC22A23-201ENST00000380298 DOCK4Q8N1I0 1966 aa28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms