RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380075.6

TRIM54-202, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 1,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-202ENST00000380075 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 C10orf82Q8WW14 230 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 IL23AQ9NPF7 189 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 GGT7Q9UJ14 662 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 TSC2P49815 1807 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 NRP1O14786 923 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 CREB3O43889 395 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 LTFP02788 710 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 FYNP06241 537 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 AP1B1Q10567 949 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 SEMA3BQ13214 749 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 NAB1Q13506 487 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 SNCBQ16143 134 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 UPP1Q16831 310 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 SCML4Q8N228 414 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 MIOSQ9NXC5 875 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM54-202ENST00000380075 SCN5AQ14524 2016 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 KLF11O14901 512 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ALDH1A2O94788 518 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SCNN1GP51170 649 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 METTL23Q86XA0 190 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TTC17Q96AE7 1141 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 KLHL29Q96CT2 875 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 COX16Q9P0S2 106 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 DSEQ9UL01 958 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 LTBP2Q14767 1821 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 E7ENQ6 273 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 C2CD2LO14523 706 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 MTSS1O43312 755 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 UNC5CO95185 931 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TGDSO95455 350 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 RIPK1Q13546 671 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 LPPQ93052 612 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ACBD6Q9BR61 282 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TMEM51Q9NW97 253 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 HHLA1C9JL84 531 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CYP11A1P05108 521 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ASRGL1Q7L266 308 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CCNYQ8ND76 341 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CDKL2Q92772 493 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 NCAM1P13591 858 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TPI1P60174 286 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 WASHC5Q12768 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 MPP5Q8N3R9 675 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SEPT8Q92599 483 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 PGBD4Q96DM1 585 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 UROC1Q96N76 676 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TET1Q8NFU7 2136 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CHUKO15111 745 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CSH1P0DML2 217 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CSH2P0DML3 217 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SKIP12755 728 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 PGAM1P18669 254 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 MX2P20592 715 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SERPINB4P48594 390 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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