RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCLK1O15075 740 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR2C2P49116 596 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB16Q96NS5 453 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT12Q99456 494 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NEU3Q9UQ49 428 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf22Q49AR2 442 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC70Q6NSX1 233 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1958Q8N8K9 716 aa28.22■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DTLQ9NZJ0 730 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H7C0C1 242 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN11O75508 207 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 COILP38432 576 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5OP48047 213 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS24P62847 133 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPPE1Q53F39 396 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRP14Q86W24 1093 aa28.2■■■□□ 2.1
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