RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ADGRB1O14514 1584 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCNDBP1O95273 360 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 APOC2P02655 101 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A4P14672 509 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATP6V1B2P21281 511 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PIK3R1P27986 724 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NTSP30990 170 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 UBE3AQ05086 875 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KCNMA1Q12791 1236 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TBCELQ5QJ74 424 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CENPTQ96BT3 561 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ACTR8Q9H981 624 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SERHLQ9NQF3 203 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MORF4L1Q9UBU8 362 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NFIBO00712 420 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MAGEC1O60732 1142 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PDE9AO76083 593 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF682O95780 498 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NFICP08651 508 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 BGNP21810 368 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NDUFA5Q16718 116 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ALG11Q2TAA5 492 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 EPC2Q52LR7 807 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 INPP5DQ92835 1189 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.36□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DERAQ9Y315 318 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 H0YC42 278 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CBX4O00257 560 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PDHXO00330 501 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TRIM13O60858 407 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KCNH1O95259 989 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ASGR1P07306 291 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CXCL8P10145 99 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SQLEQ14534 574 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 AMHR2Q16671 573 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GPC2Q8N158 579 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SNTG2Q9NY99 539 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SLC28A1O00337 649 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 C2CD2LO14523 706 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NDST1P52848 882 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 BCL2L1Q07817 233 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 VAC14Q08AM6 782 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ANGPT1Q15389 498 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MZT2AQ6P582 158 aa7.36□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 USP49Q70CQ1 688 aa7.36□□□□□ -1.23
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