RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pex11bQ9Z210 259 aa31.38■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r54K7N649 806 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aff1O88573 1216 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PltpP55065 493 aa31.37■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc38a5Q3U1J0 479 aa31.37■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cox8aQ64445 69 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trim17Q7TPM3 477 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Timm29Q8BGX2 266 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Asb14Q8C6Y6 587 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Epn2Q8CHU3 595 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mark1Q8VHJ5 795 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa31.37■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arl4aP61213 200 aa31.36■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dpysl3Q62188 570 aa31.36■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr59Q8C0M0 992 aa31.36■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5622Q810Q0 167 aa31.35■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FntbQ8K2I1 437 aa31.35■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rell1Q8K2J7 272 aa31.35■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TMEM121BQ99MX7 572 aa31.35■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam174aQ9D3L0 190 aa31.35■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa31.35■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncor1Q60974 2453 aa31.34■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abhd12bG3UZN6 359 aa31.34■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa31.34■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trip4Q9QXN3 581 aa31.33■■■□□ 2.61
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa31.32■■■□□ 2.6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrc4bP0C192 709 aa31.32■■■□□ 2.6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ZfaP23607 742 aa31.32■■■□□ 2.6
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HiraQ61666 1015 aa31.32■■■□□ 2.6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tdpoz3Q717B4 365 aa31.32■■■□□ 2.6
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
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