RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036229.12

Ctdp1-201, Transcript of RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdp1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Uba3Q8C878 462 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr806Q8VFI2 313 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nsmce2Q91VT1 247 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fbxl20Q9CZV8 436 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q9D3J9 298 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tgm5Q9D7I9 724 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Akr1c12Q9JLI0 323 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa14.97□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Epb41P48193 858 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aqp1Q02013 269 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ak8Q32M07 479 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gngt2Q61017 69 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Grid2Q61625 1007 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fam214aQ69ZK7 1075 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc36a3Q811P0 477 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc184Q8BMK5 191 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc47a1Q8K0H1 567 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MyocdQ8VIM5 935 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cul2Q9D4H8 745 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slco1a4Q9EP96 670 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Spag4Q9JJF2 443 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 CtsmQ9JL96 333 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 TfebQ9R210 475 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kcnt2D3Z649 1135 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cdo1P60334 200 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Abce1P61222 599 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Snx27Q3UHD6 539 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Galnt10Q6P9S7 603 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 DaglaQ6WQJ1 1044 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MaelQ8BVN9 434 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Plekha4Q8VC98 588 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cab39lQ9DB16 337 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gimd1E9PW74 217 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zfp457L7N1X4 647 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc153P0C7Q1 202 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc1a2P43006 572 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 NrlP54846 237 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tubgcp3P58854 905 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sycp3P70281 254 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Abhd10Q6PE15 297 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Clec4b1Q7TS58 209 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ush1gQ80T11 461 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf423Q80TS5 1292 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Plcl2Q8K394 1128 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pla2g12bQ99P27 195 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Polr3eQ9CZT4 710 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tspan17Q9D7W4 270 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Vav3Q9R0C8 847 aa14.96□□□□□ -0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ank1Q02357 1862 aa14.96□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Alms1Q8K4E0 3251 aa14.96□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Spats1A2RRY8 269 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 TriqkB2B9E1 86 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm4846B2RWH8 538 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Osbpl8B9EJ86 889 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Krt6aP50446 553 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dnal1Q05A62 190 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kmt5aQ2YDW7 349 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sp140Q6NSQ5 534 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sel1l3Q80TS8 1137 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nipal4Q8BZF2 406 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Depdc7Q91WS7 511 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Usp12Q9D9M2 370 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rap1gapA2ALS5 663 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zfp362B1ASA5 418 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Vmn2r65G3X931 845 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Serpinb3aG3X9V8 387 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Hcn3O88705 779 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Erbb2P70424 1256 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cct7P80313 544 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fbxo39Q5NBU5 443 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zpbp2Q6X786 326 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Amigo2Q80ZD9 519 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q8BHN7 327 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kansl2Q8BQR4 486 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf467Q8JZL0 594 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MycsQ9Z304 431 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Spag17Q5S003 2320 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Copz1P61924 177 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 LbpQ61805 481 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trim14Q8BVW3 440 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Parp9Q8CAS9 866 aa14.95□□□□□ -0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Colgalt1Q8K297 617 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms