Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Copz1P61924 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Copz1P61924 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Copz1P61924 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Copz1P61924 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Copz1P61924 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Copz1P61924 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Copz1P61924 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Copz1P61924 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Copz1P61924 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Copz1P61924 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Copz1P61924 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Copz1P61924 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Copz1P61924 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Copz1P61924 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Copz1P61924 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Copz1P61924 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Copz1P61924 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Copz1P61924 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Copz1P61924 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Copz1P61924 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Copz1P61924 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Copz1P61924 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Copz1P61924 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Copz1P61924 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Copz1P61924 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Copz1P61924 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Copz1P61924 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Copz1P61924 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Copz1P61924 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Copz1P61924 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Copz1P61924 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Copz1P61924 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Copz1P61924 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Copz1P61924 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Copz1P61924 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Copz1P61924 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Copz1P61924 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Copz1P61924 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Copz1P61924 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Copz1P61924 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Copz1P61924 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Copz1P61924 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Copz1P61924 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Copz1P61924 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Copz1P61924 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copz1P61924 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Copz1P61924 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Copz1P61924 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Copz1P61924 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Copz1P61924 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Copz1P61924 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Copz1P61924 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Copz1P61924 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Copz1P61924 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Copz1P61924 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Copz1P61924 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Copz1P61924 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Copz1P61924 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Copz1P61924 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Copz1P61924 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Copz1P61924 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copz1P61924 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Copz1P61924 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copz1P61924 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Copz1P61924 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Copz1P61924 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Copz1P61924 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Copz1P61924 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Copz1P61924 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Copz1P61924 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Copz1P61924 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Copz1P61924 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copz1P61924 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Copz1P61924 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Copz1P61924 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Copz1P61924 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Copz1P61924 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Copz1P61924 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Copz1P61924 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Copz1P61924 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copz1P61924 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Copz1P61924 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copz1P61924 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copz1P61924 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copz1P61924 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copz1P61924 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Copz1P61924 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copz1P61924 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Copz1P61924 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copz1P61924 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Copz1P61924 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copz1P61924 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Copz1P61924 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copz1P61924 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Copz1P61924 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copz1P61924 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copz1P61924 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copz1P61924 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copz1P61924 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms