RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029014.15

Rbm38-201, Transcript of RNA-binding protein 38, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rbm38, Length 1,768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38-201ENSMUST00000029014 ClmpQ8R373 373 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 PlvapQ91VC4 438 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Snf8Q9CZ28 258 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Tsc1Q9EP53 1161 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Plod1Q9R0E2 728 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Plxna4Q80UG2 1893 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Gpr161B2RPY5 545 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Atf6F6VAN0 656 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Tcf3P15806 651 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Cdo1P60334 200 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Adcyap1r1P70205 496 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Mcm9Q2KHI9 1134 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Eif2b4Q61749 524 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Dnajb13Q80Y75 316 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Caap1Q8VDY9 356 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Lpin1Q91ZP3 924 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 ArpinQ9D0A3 226 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Ubqln5Q9D4I8 510 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Spata9Q9D9R3 252 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Prmt1Q9JIF0 371 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 PolhQ9JJN0 694 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Gm11758A2BEI6 360 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Gm11757A2BEI8 360 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Vmn2r88L7N1W8 857 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 ShdO88834 343 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 TubP50586 505 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 St3gal1P54751 337 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Ifnl2Q4VK74 193 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Bdkrb1Q61125 334 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 TCAIMQ66JZ4 499 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Fndc3aQ8BX90 1198 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Atg14Q8CDJ3 492 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Eef1akmt2Q9D853 244 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 AuhQ9JLZ3 314 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Eno1P17182 434 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Upp1P52624 311 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Sycp3P70281 254 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 CblbQ3TTA7 982 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Gm14685Q52KH6 695 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Cdkn3Q810P3 211 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Il17reQ8BH06 637 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Olfm2Q8BM13 448 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Bicd1Q8BR07 835 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Cacnb2Q8CC27 655 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Emid1Q91VF5 444 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Samd15F6XZJ7 620 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 BC024978J3QPC3 361 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 CopeO89079 308 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 StilQ60988 1262 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Atp11bQ6DFW5 1175 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Olfr20Q7TRX9 314 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Kctd13Q8BGV7 329 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Lrp8Q924X6 996 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Mcoln1Q99J21 580 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Marc1Q9CW42 340 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Rad9aQ9Z0F6 389 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Mbd1Q9Z2E2 636 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Usp51B1AY15 661 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Serpina3iD3Z450 408 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Gm5571P01639 130 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Htr2cP34968 459 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 PorP37040 678 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Irs2P81122 1321 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Csf2raQ00941 388 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Cyp2c65Q148B1 490 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Fbxo39Q5NBU5 443 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Adad1Q5SUE7 619 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Got1l1Q7TSV6 404 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Phactr3Q8BYK5 558 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Pak5Q8C015 719 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Prr33Q8C494 260 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Vangl2Q91ZD4 521 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 MlxiplQ99MZ3 864 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Cyp4f13Q99N19 523 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Alg14Q9D081 217 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Ovca2Q9D7E3 225 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Kifc1Q9QWT9 674 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Siah3B2RWG3 268 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Exoc3l2D3YUP5 789 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Abhd12bG3UZN6 359 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Folr1P35846 255 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Dpf3P58269 378 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Pgap2Q3TQR0 254 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbm38-201ENSMUST00000029014 Igfbp7Q61581 281 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.2 ms