RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617053.2

PNMA8C-201, Transcript of PNMA family member 8C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8C, Length 4,255 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8C-201ENST00000617053 BBS12Q6ZW61 710 aa9.5□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.5□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.5□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.5□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 MID2Q9UJV3 735 aa9.5□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.5□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 MDM4O15151 490 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 HOXA2O43364 376 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CENPTQ96BT3 561 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF558Q96NG5 402 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 MUC3BQ9H195 1237 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 NUMA1Q14980 2115 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 FOCADQ5VW36 1801 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PER2O15055 1255 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 DIAPH2O60879 1101 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CXCL14O95715 111 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TGM2P21980 687 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 LMO2P25791 158 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SERPINB9P50453 376 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ITIH4Q14624 930 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 FUKQ8N0W3 1084 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 BADQ92934 168 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 F2P00734 622 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 DPYSL3Q14195 570 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 DDR2Q16832 855 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PMF1Q6P1K2 205 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TWNKQ96RR1 684 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 LHX5Q9H2C1 402 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.49□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SH3BP5O60239 455 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 LRCH4O75427 683 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PIRTP0C851 137 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SCTRP47872 440 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PRMT2P55345 433 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 POLBP06746 335 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ITGAVP06756 1048 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 FDFT1P37268 417 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 NDUFV1P49821 464 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TWF1Q12792 350 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 MYLPFQ96A32 169 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 HSFY1Q96LI6 401 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CORO1BQ9BR76 489 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CD248Q9HCU0 757 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 DOCK1Q14185 1865 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 KRT34O76011 436 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CLCNKBP51801 687 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 KDSRQ06136 332 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 RIPK1Q13546 671 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 XYLT1Q86Y38 959 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SPATA17Q96L03 361 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 LGMNQ99538 433 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 EDN1P05305 212 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 CCR1P32246 355 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 ASPAP45381 313 aa9.48□□□□□ -0.89
PNMA8C-201ENST00000617053 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms