RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562813.1

BBS2-207, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 2

Gene BBS2, Length 4,026 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-207ENST00000562813 TDRPQ86YL5 185 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SCUBE3Q8IX30 993 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SLC4A11Q8NBS3 891 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 EME1Q96AY2 570 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SENP8Q96LD8 212 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 DYRK4Q9NR20 520 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 PKD2L2Q9NZM6 624 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 GIT1Q9Y2X7 761 aa5□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SUPT3HB4E1H0 165 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 RAMP2O60895 175 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 GLP2RO95838 553 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 AMPD1P23109 780 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TWF1Q12792 350 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 OVGP1Q12889 678 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 MAP2K5Q13163 448 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ARHGEF7Q14155 803 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CRYMQ14894 314 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 NOMO1Q15155 1222 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TCEAL1Q15170 157 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 LCA5Q86VQ0 697 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 AGR3Q8TD06 166 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TEX12Q9BXU0 123 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CD274Q9NZQ7 290 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 COL20A1Q9P218 1284 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 DYTNA2CJ06 578 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 FCHO1O14526 889 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 MDM4O15151 490 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CILPO75339 1184 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ATP6V1G2O95670 118 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ALDH2P05091 517 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 HMBSP08397 361 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 FCGR1AP12314 374 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TPSB2P20231 275 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CYP3A5P20815 502 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 DRD4P21917 467 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SCNN1AP37088 669 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TBX4P57082 545 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 IL1RL1Q01638 556 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 DSG1Q02413 1049 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CDH18Q13634 790 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 GTF2H3Q13889 308 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TPSAB1Q15661 275 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ACCSLQ4AC99 568 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 WLSQ5T9L3 541 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ZFP1Q6P2D0 407 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TRABD2AQ86V40 505 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 RDH11Q8TC12 318 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 FICDQ9BVA6 458 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 CPA4Q9UI42 421 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 TMCO1Q9UM00 188 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 A0A087X1B8 175 aa4.99□□□□□ -1.61
BBS2-207ENST00000562813 A0A096LPK6 155 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms