RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 SDE2Q6IQ49 451 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CHST9Q7L1S5 443 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 MFN1Q8IWA4 741 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF366Q8N895 744 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 GGA2Q9UJY4 613 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CKAP5Q14008 2032 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 I6L893 689 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ALDH1A2O94788 518 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ADCY5O95622 1261 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 HLA-EP13747 358 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 FERP16591 822 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCB4P21439 1286 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PRKCHP24723 683 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CCR1P32246 355 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TPM4P67936 248 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CENPCQ03188 943 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SPEM2Q0P670 501 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 LMAN2Q12907 356 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PTP4A2Q12974 167 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 FUT11Q495W5 492 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 C14orf80Q86SX3 495 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 DNAAF5Q86Y56 855 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 IGSF8Q969P0 613 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 GABRG3Q99928 467 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SIK2Q9H0K1 926 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CD248Q9HCU0 757 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CD93Q9NPY3 652 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 F5H5T6 163 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PAGE1O75459 146 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 NDUFV2P19404 249 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ATP11AP98196 1134 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 DEUP1Q05D60 604 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ASIC2Q16515 512 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 MBLAC2Q68D91 279 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 RNF43Q68DV7 783 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 FBXL22Q6P050 247 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CACUL1Q86Y37 369 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 UCMAQ8WVF2 138 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 LMLNQ96KR4 655 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TKTL2Q9H0I9 626 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 A0A1W2PQC6 194 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 H0Y626 953 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC2A3P11169 496 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SCNN1AP37088 669 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CXCR3P49682 368 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 UBASH3AP57075 661 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CDH18Q13634 790 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 NFKBIBQ15653 356 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PTPRNQ16849 979 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 CDO1Q16878 200 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PLK5Q496M5 336 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 MPP7Q5T2T1 576 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-211ENST00000559850 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms