RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 KLK14Q9P0G3 267 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 FCHO1O14526 889 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 DCLK1O15075 740 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 GYG2O15488 501 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 TREHO43280 583 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 ADCY6O43306 1168 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SNNO75324 88 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MAP3K6O95382 1288 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 CBX6O95503 412 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 T-ENOLP0DO92 83 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MYL4P12829 197 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 ADRA1BP35368 520 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 CDK7P50613 346 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 RAB27AP51159 221 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 TKTL1P51854 596 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 DAOAP59103 153 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 C1QTNF8P60827 252 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 OCRLQ01968 901 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 BST1Q10588 318 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 OVGP1Q12889 678 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MTM1Q13496 603 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 CHI3L2Q15782 390 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 CCDC153Q494R4 210 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 TEX44Q53QW1 395 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 C6orf163Q5TEZ5 329 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 WSCD1Q658N2 575 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PACS1Q6VY07 963 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 BEND5Q7L4P6 421 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 FAM35AQ86V20 835 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 LCA5Q86VQ0 697 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 RASSF3Q86WH2 238 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 METTL23Q86XA0 190 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 CCNYQ8ND76 341 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 FAM13CQ8NE31 585 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PPP4R1Q8TF05 950 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 ISL2Q96A47 359 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 HDAC11Q96DB2 347 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PGBD4Q96DM1 585 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SENP8Q96LD8 212 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 APBA2Q99767 749 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 DCLRE1BQ9H816 532 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 DSEQ9UL01 958 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 TRIM33Q9UPN9 1127 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 WDR27A2RRH5 827 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 VGLL3A8MV65 326 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PTGESO14684 152 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 TIMM44O43615 452 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 CREB3O43889 395 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 AP1G2O75843 785 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 USP1O94782 785 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 AP2A1O95782 977 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 LTFP02788 710 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SERPINE1P05121 402 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MPOP05164 745 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 APOA4P06727 396 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 THP07101 528 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 ODC1P11926 461 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 AKR1A1P14550 325 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 DNAJB1P25685 340 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MGAT1P26572 445 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PSMB4P28070 264 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SERPINB3P29508 390 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 NPY2RP49146 381 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SERPINB8P50452 374 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PRKAA2P54646 552 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PDE1BQ01064 536 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SEMA3BQ13214 749 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 NME3Q13232 169 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 BMPR2Q13873 1038 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 RAB41Q5JT25 222 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 SYCP2LQ5T4T6 812 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-205ENST00000546891 MROH9Q5TGP6 573 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms