RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SPTLC2	O15270	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	NCR1	O76036	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT3	O95989	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CSF1	P09603	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ALAD	P13716	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP3CB	P16298	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCD3	P28288	659 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	THBS4	P35443	961 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTM5	P46439	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	VAV2	P52735	878 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPA	Q15257	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PDILT	Q8N807	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GLG1	Q92896	1179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		A1L4Q6	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		K7ENM7	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FIBP	O43427	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN3	O60637	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MCM5	P33992	734 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MTHFS	P49914	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	BFSP2	Q13515	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	BAK1	Q16611	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM2	Q99965	735 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MED14	O60244	1454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	EEA1	Q15075	1411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SPRY2	O43597	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RHO	P08100	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LIPA	P38571	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CLCN2	P51788	898 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	REST	Q13127	1097 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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