RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.35□□□□□ -1.39
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LMO3-225ENST00000541295 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.35□□□□□ -1.39
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LMO3-225ENST00000541295 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-225ENST00000541295 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.35□□□□□ -1.39
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LMO3-225ENST00000541295 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
LMO3-225ENST00000541295 PRCPP42785 496 aa6.34□□□□□ -1.39
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