RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SIPA1L1O43166 1804 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 LTBP1Q14766 1721 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 AIM2O14862 343 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MAGEB3O15480 346 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 KCNN4O15554 427 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ENDOD1O94919 500 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 GSRP00390 522 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 APRTP07741 180 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C7P10643 843 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NPR1P16066 1061 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 HOXD12P35452 270 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CRKP46108 304 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 THOP1P52888 689 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MYL6P60660 151 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 UBXN2AP68543 259 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 GHRHRQ02643 423 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MOGQ16653 247 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MAVSQ7Z434 540 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RDH11Q8TC12 318 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 USP6NLQ92738 828 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ISOC1Q96CN7 298 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ASB9Q96DX5 294 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RANBP9Q96S59 729 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PKP2Q99959 881 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CORO1BQ9BR76 489 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RMI1Q9H9A7 625 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 COG4Q9H9E3 785 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 POLLQ9UGP5 575 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 FEM1BQ9UK73 627 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 EP400Q96L91 3159 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 FUOMA2VDF0 154 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 FBP2O00757 339 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 APOL1O14791 398 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MPOP05164 745 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MMP10P09238 476 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZNF24P17028 368 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CDH3P22223 829 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 S100A1P23297 94 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 HALP42357 657 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PSMD8P48556 350 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ENTPD1P49961 510 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CDKL1Q00532 357 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PFKPQ01813 784 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PPP2R5DQ14738 602 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C16orf87Q6PH81 154 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SNX32Q86XE0 403 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 HACE1Q8IYU2 909 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TUBA1CQ9BQE3 449 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C1orf50Q9BV19 199 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 WDR41Q9HAD4 459 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 EMCNQ9ULC0 261 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 USP18Q9UMW8 372 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TPP1O14773 563 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 GIPC1O14908 333 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms