RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402		B4DGG1	531 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PLIN1	O60240	522 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	CNTN5	O94779	1100 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	NEK3	P51956	506 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SRL	Q86TD4	932 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	GPR78	Q96P69	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402		H3BNX3	289 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	IKBKB	O14920	756 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	CYP3A4	P08684	503 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FGF2	P09038	288 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TEC	P42680	631 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SLC37A1	P57057	533 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	LINC00205	P59089	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	GRM4	Q14833	912 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	MIDN	Q504T8	468 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	MUL1	Q969V5	352 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402		A0A0G2JK05	382 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	UGDH	O60701	494 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	EPN2	O95208	641 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	LARGE1	O95461	756 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	ABCB4	P21439	1286 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	CYP3A7	P24462	503 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	CDK7	P50613	346 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	STARD3	Q14849	445 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	PGM5	Q15124	567 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	SPTLC2	O15270	562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	ATG13	O75143	517 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	CER1	O95813	267 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	PPM1A	P35813	382 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	POLE2	P56282	527 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	EID2B	Q96D98	161 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	TTC3	P53804	2025 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MATR3-223	ENST00000514402	FFAR2	O15552	330 aa		4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms