RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 MED7O43513 233 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT5P13647 590 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNH2Q12809 1159 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FIBINQ8TAL6 211 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 GANCQ8TET4 914 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 KAT5Q92993 513 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 MOCS3O95396 460 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 IGLV3-27P01718 113 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 AFPP02771 609 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ASLP04424 464 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF883P0CG24 379 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CD70P32970 193 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ACSL1P33121 698 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRNQ16849 979 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-BQ31612 363 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TTI2Q6NXR4 508 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SGK2Q9HBY8 427 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SCML1Q9UN30 329 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TLR6Q9Y2C9 796 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 GABBR2O75899 941 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SEMA4FO95754 770 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC6A4P31645 630 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SGSHP51688 502 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS14P62263 151 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CDH18Q13634 790 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CREBRFQ8IUR6 639 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 LMO3Q8TAP4 145 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSWIM1Q9BR11 485 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP83Q9Y592 693 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1B0GVT2 93 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 BIN1O00499 593 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FSBPO95073 299 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 APOEP02649 317 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FTH1P19P0C7X4 201 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 STX17P56962 302 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 PAK1Q13153 545 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 NNTQ13423 1086 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF19Q8IW93 802 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RHBDD1Q8TEB9 315 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC17Q96AE7 1141 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM81BQ96LP2 452 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 MED15Q96RN5 788 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 IL21RQ9HBE5 538 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TJP2Q9UDY2 1190 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM221BA6H8Z2 402 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CALCAP01258 141 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 GPD2P43304 727 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 MS4A13Q5J8X5 152 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM59Q8IWR1 403 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 WFDC5Q8TCV5 224 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 STK32AQ8WU08 396 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC6Q99741 560 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 OSGEPQ9NPF4 335 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CKAP5Q14008 2032 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMA1P25391 3075 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 FLRT2O43155 660 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CD27P26842 260 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 NNMTP40261 264 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 CSKP41240 450 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS24P62847 133 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms