RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	EPHB2	P29323	1055 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SERPINA4	P29622	427 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC37A1	P57057	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	C21orf58	P58505	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	YPEL5	P62699	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	DMWD	Q09019	674 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR78	Q96P69	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM155B	O75949	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	IGFBP2	P18065	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP3A7	P24462	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKAA2	P54646	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	TAF5	Q15542	800 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	PIGK	Q92643	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284		E7EVH7	732 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	INPPL1	O15357	1258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	PLAU	P00749	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	ADD2	P35612	726 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL4C	P56559	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	MTA1	Q13330	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	CUL4B	Q13620	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-215	ENST00000498284	IRAK2	O43187	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	USP12	O75317	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	BCAR3	O75815	825 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT38	O76015	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CNTN5	O94779	1100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SGPL1	O95470	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP21A2	P08686	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR35	P0CG20	571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	AKR1A1	P14550	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	KEL	P23276	732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SOX2	P48431	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RCAN1	P53805	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SHC2	P98077	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HSF1	Q00613	529 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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