RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDHA1	P08559	390 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRR35	P0CG20	571 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NR2F6	P10588	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NXPH1	P58417	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAP2	Q03519	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLUL1	Q15846	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	VCAN	P13611	3396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASB14	A6NK59	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPAA1	O43292	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLA2G6	O60733	806 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRDM1	O75626	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FGB	P02675	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CSF2RA	P15509	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ITIH3	Q06033	890 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAB30	Q15771	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PBK	Q96KB5	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q9Y3F1	56 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	LCT	P09848	1927 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A0B4J269	797 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TISP43	B9A030	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MT-CO1	P00395	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAL	P21145	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CYP2C18	P33260	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC1A4	P43007	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TDO2	P48775	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	STAT2	P52630	851 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	BEX3	Q00994	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TFAP4	Q01664	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAPK7	Q13164	816 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TUBB3	Q13509	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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