RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 GCLMP48507 274 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF543Q08ER8 600 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BNIP3Q12983 259 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGADQ13349 1161 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PHKG1Q16816 387 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS21Q2M5E4 152 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 MMP19Q99542 508 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 VTA1Q9NP79 307 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MGAMO43451 1857 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L5A8MUK1 530 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GIPC1O14908 333 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SGTAO43765 313 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM155BO75949 473 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 INHBAP08476 426 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RPA1P27694 616 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CREB5Q02930 508 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC18A2Q05940 514 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BFSP1Q12934 665 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 EPC2Q52LR7 807 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT80Q6KB66 452 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf74Q86VG3 221 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 HPS1Q92902 700 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TAMM41Q96BW9 452 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PGBD4Q96DM1 585 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP4Q96MN2 994 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PKP2Q99959 881 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GID8Q9NWU2 228 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GGA3Q9NZ52 723 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KRBA1A5PL33 1030 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NJY4 79 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SGK1O00141 431 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM16LQ309B1 348 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX44Q53QW1 395 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 UCN2Q96RP3 112 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 SQORQ9Y6N5 450 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-203ENST00000439720 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA13P48723 471 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ESRRGP62508 458 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GNA12Q03113 381 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP3CAQ08209 521 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SREBF2Q12772 1141 aa8.62□□□□□ -1.03
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