RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439079.1

LINC00415-201, long intergenic non-protein coding RNA 415, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00415, Length 435 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00415-201ENST00000439079 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 BRF2Q9HAW0 419 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 POLLQ9UGP5 575 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 DSEQ9UL01 958 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CFAP45Q9UL16 551 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 WASF3Q9UPY6 502 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 C2CD2Q9Y426 696 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 MGAMO43451 1857 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa4.96□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SSC5DA1L4H1 1573 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 MYO9BQ13459 2157 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 A0A0B4J203 849 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 GLOD5A6NK44 160 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ERVV-1B6SEH8 477 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SGK1O00141 431 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF263O14978 683 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 RTN2O75298 545 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TULP3O75386 442 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TRIM16O95361 564 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 PRAMEF1O95521 474 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 RPS12P25398 132 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 COL8A1P27658 744 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TMOD1P28289 359 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 GCH1P30793 250 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CASP3P42574 277 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 NRG3P56975 720 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 MXRA7P84157 204 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 RPA4Q13156 261 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TUSC3Q13454 348 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 NFKBIBQ15653 356 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TRIM60Q495X7 471 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CPZQ66K79 652 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 Q7L0L9 218 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 NLRP10Q86W26 655 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CEP76Q8TAP6 659 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ITFG2Q969R8 447 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 KRT23Q9C075 422 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 PANK3Q9H999 370 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ANO10Q9NW15 660 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 EHD2Q9NZN4 543 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 NFU1Q9UMS0 254 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 FZD1Q9UP38 647 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ASB1Q9Y576 335 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 SPEF2Q9C093 1822 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.95□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 ARHGAP10A1A4S6 786 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 CTAGE9A4FU28 777 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 E7EVH7 732 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 K7EPI3 171 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 M0QX08 132 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 BTN3A1O00481 513 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 TP73O15350 636 aa4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINC00415-201ENST00000439079 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms