RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 MCOLN2Q8IZK6 566 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 FBXL16Q8N461 479 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 FIBCD1Q8N539 461 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PARVBQ9HBI1 364 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 IMPAD1Q9NX62 359 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 A0A087WXM4 84 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 UBDO15205 165 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NDUFS3O75489 264 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 RASSF9O75901 435 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 VCLP18206 1134 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 SP100P23497 879 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 GRK4P32298 578 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.775e-8■□□□□ 9.7
TNS3-204ENST00000428457 PGM5Q15124 567 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 BOLA3Q53S33 107 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 DHFR2Q86XF0 187 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 REPS2Q8NFH8 660 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 GIPC3Q8TF64 312 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 BAP1Q92560 729 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 RBBP8Q99708 897 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 TUFMP49411 452 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PDK4Q16654 411 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 TTC7BQ86TV6 843 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 SIX5Q8N196 739 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 F5H5T6 163 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NBNO60934 754 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 ALOX12P18054 663 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 GSSP48637 474 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 RAB14P61106 215 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NR1D2Q14995 579 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 RGS21Q2M5E4 152 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 LRRC8DQ7L1W4 858 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 LATS2Q9NRM7 1088 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa10.22□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 GAKO14976 1311 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NRCAMQ92823 1304 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CALCAP01258 141 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 HMBSP08397 361 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 HIST1H2ADP20671 130 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PBX1P40424 430 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 GSTA3Q16772 222 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CBWD6Q4V339 395 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CBWD3Q5JTY5 395 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CBWD5Q5RIA9 395 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 ARMC4Q5T2S8 1044 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 LPCAT4Q643R3 524 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CES3Q6UWW8 571 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 C4orf22Q6V702 233 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 HOMEZQ8IX15 550 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 FITM2Q8N6M3 262 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 HIST1H2AJQ99878 128 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 H2AFJQ9BTM1 129 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CEP44Q9C0F1 390 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.775e-7■□□□□ 11.3
TNS3-204ENST00000428457 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CYB561D2O14569 222 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 GSNP06396 782 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CKBP12277 381 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 FDFT1P37268 417 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 RIPK1Q13546 671 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 GPR142Q7Z601 462 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 LUZP2Q86TE4 346 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CROCCP3Q8IVE0 287 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.777e-8■■■■■ 30.9
TNS3-204ENST00000428457 PHF21AQ96BD5 680 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 CHKBQ9Y259 395 aa10.21□□□□□ -0.77
TNS3-204ENST00000428457 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TIMM44O43615 452 aa10.21□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TOMM70O94826 608 aa10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms