RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 MYO19Q96H55 970 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SERPINB11Q96P15 392 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 NOX5Q96PH1 765 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 HHIPQ96QV1 700 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CHP1Q99653 195 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 NUP58Q9BVL2 599 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ISCUQ9H1K1 167 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CD93Q9NPY3 652 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 DDIT4Q9NX09 232 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ADAM22Q9P0K1 906 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 STIM2Q9P246 746 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 DEC1Q9P2X7 70 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 NEU3Q9UQ49 428 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CEP83Q9Y592 693 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 RAD54BQ9Y620 910 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 R4GN57 208 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 FAM186AA6NE01 2351 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PI4KAP42356 2102 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SPEGQ15772 3267 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 A0A087X0T9 212 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 DRGXA6NNA5 263 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PROB1E7EW31 1015 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 RNF103O00237 685 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 DCLK1O15075 740 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CCP110O43303 1012 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 LAMTOR5O43504 91 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 RTN2O75298 545 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PAGE1O75459 146 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SERPING1P05155 500 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 FAM228BP0C875 321 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 KRT3P12035 628 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 GZMAP12544 262 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 TCF4P15884 667 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PDGFRAP16234 1089 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 GPD1P21695 349 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PRKCHP24723 683 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 HOXA6P31267 233 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CCR1P32246 355 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 RDXP35241 583 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ADRA1BP35368 520 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CHKAP35790 457 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PLA2G5P39877 138 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 IL12RB1P42701 662 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PTPN9P43378 593 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 NSFP46459 744 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SLC11A2P49281 568 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SULT1E1P49888 294 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CCR3P51677 355 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF75DP51815 510 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ADKP55263 362 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 TPM4P67936 248 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ATP11AP98196 1134 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 AMPD2Q01433 879 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 DEUP1Q05D60 604 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 MAMLD1Q13495 774 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ENPP2Q13822 863 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CRY1Q16526 586 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CA9Q16790 459 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 PTPRNQ16849 979 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CDO1Q16878 200 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 FUT11Q495W5 492 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 FBXO43Q4G163 708 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ALFQ53S48 1182 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 MPP7Q5T2T1 576 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 MANEALQ5VSG8 457 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 FBXL22Q6P050 247 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SYT13Q7L8C5 426 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 RASSF3Q86WH2 238 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms