RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CPT1BQ92523 772 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ISCA1Q9BUE6 129 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TM2D2Q9BX73 214 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 AGAP5A6NIR3 686 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 E7EVH7 732 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 DSCR3O14972 297 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 EPHB2P29323 1055 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINA4P29622 427 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ADD2P35612 726 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL4CP56559 192 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC37A1P57057 533 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 YPEL5P62699 121 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CUL4BQ13620 913 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 COLEC12Q5KU26 742 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RINLQ6ZS11 566 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGKQ92643 395 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 FCRL5Q96RD9 977 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM2Q9C040 744 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 KCND3Q9UK17 655 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 B9A039 149 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TP73O15350 636 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 INPPL1O15357 1258 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTN5O94779 1100 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PLAUP00749 431 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ST6GAL1P15907 406 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX2P48431 317 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGGTB-202ENST00000370826 SHC2P98077 582 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 MTA1Q13330 715 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 DCTN1Q14203 1278 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 NEK8Q86SG6 692 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 UEVLDQ8IX04 471 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 EXD3Q8N9H8 876 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RILPL2Q969X0 211 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 NPAS1Q99742 590 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RCE1Q9Y256 329 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 BCAR3O75815 825 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT38O76015 456 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SGPL1O95470 568 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR35P0CG20 571 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS6KB1P23443 525 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP25P42331 645 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.715e-8■■□□□ 13.8
RABGGTB-202ENST00000370826 HSF1Q00613 529 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CFHR1Q03591 330 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC142Q17RM4 750 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
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