RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LZTS1Q9Y250 596 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TISP43B9A030 160 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 B9A039 149 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPT4O43236 478 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP21A2P08686 494 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TACR3P29371 465 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXD12P35452 270 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC37A1P57057 533 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXL2P58012 376 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 INHBEP58166 350 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBA4AP68366 448 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSIP1Q8NA03 581 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR78Q96P69 363 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHODLQ9H9P2 273 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 AOX1Q06278 1338 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMSYQ7Z589 1322 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRRT4C9JH25 899 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRM8O00222 908 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCAM2O15394 837 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNTN5O94779 1100 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 KAT7O95251 611 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKCGP05129 697 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFBP2P18065 325 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP3A7P24462 503 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 B4GALNT1Q00973 533 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 NHLH1Q02575 133 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFF2Q03403 129 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMWDQ09019 674 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC12A1Q13621 1099 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFR3AQ14156 821 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHRS13Q6UX07 377 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 UEVLDQ8IX04 471 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGKQ92643 395 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 COG8Q96MW5 612 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLPBQ9H078 707 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 DERAQ9Y315 318 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 STX16O14662 325 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRHO14718 337 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 INPPL1O15357 1258 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP12O75317 370 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKR1A1P14550 325 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGM2P21980 687 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 IDUAP35475 653 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNPLA4P41247 253 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF84P51523 738 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 YPEL5P62699 121 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHC2P98077 582 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTA1Q13330 715 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCTN1Q14203 1278 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD1Q15327 319 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC23BQ15437 767 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC24Q50LG9 513 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALFQ53S48 1182 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms