RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359947.8

PTPRF-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 7,727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-201ENST00000359947 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 USP45Q70EL2 814 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 EXD1Q8NHP7 514 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 MEI4A8MW99 385 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 SLURP2P0DP57 97 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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PTPRF-201ENST00000359947 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 126.3
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PTPRF-201ENST00000359947 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.91■□□□□ 0.14
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PTPRF-201ENST00000359947 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.91■□□□□ 0.14
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PTPRF-201ENST00000359947 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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PTPRF-201ENST00000359947 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.9■□□□□ 0.14
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PTPRF-201ENST00000359947 SLC5A5Q92911 643 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-201ENST00000359947 ASB7Q9H672 318 aa15.9■□□□□ 0.14
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