RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH1A1P00352 501 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK8P49336 464 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3R3Q92569 461 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ARMCX1Q9P291 453 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 BBIP1A8MTZ0 92 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CHST10O43529 356 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM20BO75063 409 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPAN19P0C672 248 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PPIL2Q13356 520 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEAL5Q5H9L2 206 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHA6Q9UN73 950 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TRMUO75648 421 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC24AO95486 1093 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB27AP51159 221 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPRNQ16849 979 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EEPD1Q7L9B9 569 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC7A14Q8TBB6 771 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGA10O75578 1167 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 LCP1P13796 627 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PPIBP23284 216 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 BAG6P46379 1132 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 USP46P62068 366 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NRF1Q16656 503 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PNPLA8Q9NP80 782 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS51Q9UID3 782 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SPEF2Q9C093 1822 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PEPDP12955 493 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNG2Q16589 344 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TKFCQ3LXA3 575 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TBCELQ5QJ74 424 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MOXD1Q6UVY6 613 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC38A2Q96QD8 506 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM118BQ9BPY3 351 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TLR10Q9BXR5 811 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.676e-6■■□□□ 14.4
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TGDSO95455 350 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNA6P17658 529 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFP69Q49AA0 526 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DPP9Q86TI2 863 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 UPB1Q9UBR1 384 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ATG7O95352 703 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SOAT1P35610 550 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNG1P51959 295 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GEMP55040 296 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM189A2Q15884 450 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 LIN52Q52LA3 116 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 AGAP3Q96P47 875 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SPAG4Q9NPE6 437 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CLN6Q9NWW5 311 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH1A2O94788 518 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNE2O96020 404 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGB6P18564 788 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMB9P28065 219 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF7Q14155 803 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM187BQ17R55 369 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MTX3Q5HYI7 312 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SPANXN3Q5MJ09 141 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FCGR1BQ92637 280 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DSEQ9UL01 958 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF112Q9ULX5 631 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HACD1B0YJ81 288 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 APOL3O95236 402 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SULT1E1P49888 294 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CNPY1Q3B7I2 92 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATS1Q496A3 300 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PERM1Q5SV97 790 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 STK40Q8N2I9 435 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 LXNQ9BS40 222 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 BCS1LQ9Y276 419 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM17Q9Y577 477 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A088AWK7 358 aa10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms