RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 SCN4AP35499 1836 aa18.75■□□□□ 0.59
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SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 S100A14Q9HCY8 104 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 VTA1Q9NP79 307 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 H3BRB1 525 aa18.71■□□□□ 0.59
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