RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 L1CAMP32004 1257 aa14.55□□□□□ -0.08
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CMTM1-201ENST00000328020 ZXDAP98168 799 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 LRRC38Q5VT99 294 aa14.55□□□□□ -0.08
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CMTM1-201ENST00000328020 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CCDC185Q8N715 623 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.55□□□□□ -0.08
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CMTM1-201ENST00000328020 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.55□□□□□ -0.08
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CMTM1-201ENST00000328020 ZWILCHQ9H900 591 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CD320Q9NPF0 282 aa14.55□□□□□ -0.08
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CMTM1-201ENST00000328020 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TFR2Q9UP52 801 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 ALG6Q9Y672 507 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1B0GVM2 712 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 E9PAM4 449 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 DAPK3O43293 454 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TBL1XO60907 577 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 SRGAP2O75044 1071 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CLDN11O75508 207 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 COMTP21964 271 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 SLC6A4P31645 630 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 GJA4P35212 333 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 ARL4AP40617 200 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CDH18Q13634 790 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 KRT81Q14533 505 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 E2F5Q15329 346 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 FBXL22Q6P050 247 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TTC8Q8TAM2 541 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 EDAQ92838 391 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 NELL2Q99435 816 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 DEC1Q9P2X7 70 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 H0Y626 953 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 H3BRJ5 948 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 GFRA2O00451 464 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 PSTPIP1O43586 416 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CREB3O43889 395 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CACNG3O60359 315 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CTHP32929 405 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CDH4P55283 916 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TPI1P60174 286 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 PDK2Q15119 407 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 C5orf22Q49AR2 442 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 RAB6CQ53S08 254 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 FYB2Q5VWT5 728 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CHST9Q7L1S5 443 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 KCTD6Q8NC69 237 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 HSPH1Q92598 858 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 BHMTQ93088 406 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 PNKPQ96T60 521 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 AMFRQ9UKV5 643 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CA14Q9ULX7 337 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 TRIOO75962 3097 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-201ENST00000328020 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-201ENST00000328020 DRGXA6NNA5 263 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-201ENST00000328020 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-201ENST00000328020 MOCS3O95396 460 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-201ENST00000328020 APODP05090 189 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-201ENST00000328020 RARAP10276 462 aa14.52□□□□□ -0.09
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