RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 TEKT4Q8WW24 435 aa16.84■□□□□ 0.29
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CHTF18-202ENST00000317063 GDF3Q9NR23 364 aa16.84■□□□□ 0.29
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CHTF18-202ENST00000317063 SCML4Q8N228 414 aa16.82■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 TCF25Q9BQ70 676 aa16.82■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 IL37Q9NZH6 218 aa16.81■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 MYBPC3Q14896 1274 aa16.81■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 P3H4Q92791 437 aa16.81■□□□□ 0.28
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA17Q96L03 361 aa16.81■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 CA3P07451 260 aa16.8■□□□□ 0.28
CHTF18-202ENST00000317063 CTSAP10619 480 aa16.8■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 PLD1Q13393 1074 aa16.8■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.8■□□□□ 0.28
CHTF18-202ENST00000317063 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CHTF18-202ENST00000317063 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CHTF18-202ENST00000317063 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.8■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 PLXNA3P51805 1871 aa16.8■□□□□ 0.28
CHTF18-202ENST00000317063 SGK1O00141 431 aa16.8■□□□□ 0.28
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