RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 MPP4Q96JB8 637 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 THP07101 528 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 CCR1P32246 355 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 ZNF197O14709 1029 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 TSPAN3O60637 253 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 USP1O94782 785 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 ARHGAP8P85298 464 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 ILDR2Q71H61 639 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PEX1O43933 1283 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 VEPH1Q14D04 833 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 MICU2Q8IYU8 434 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 TMCC1O94876 653 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PGM3O95394 542 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 CYP4X1Q8N118 509 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 CPXM1Q96SM3 734 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 FAM155BO75949 473 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 IRF1P10914 325 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 NRF1Q16656 503 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 PLD3Q8IV08 490 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 MARK4Q96L34 752 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 SEPHS2Q99611 448 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 AKT1P31749 480 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 ADRM1Q16186 407 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 CERS2Q96G23 380 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 CROTQ9UKG9 612 aa22.21■■□□□ 1.15
USP12-201ENST00000282344 MRASO14807 208 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 ANPEPP15144 967 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 TRPC1P48995 793 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 MON1BQ7L1V2 547 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 SPATA17Q96L03 361 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 GSC2O15499 205 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 LRCH4O75427 683 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 RTP1P59025 263 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 CHRNB3Q05901 458 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 CPT1BQ92523 772 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 COL20A1Q9P218 1284 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 AP4S1Q9Y587 144 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 RASSF9O75901 435 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 ENDOD1O94919 500 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 EFEMP1Q12805 493 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 COG4Q9H9E3 785 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 INPP4BO15327 924 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 RECQL4O94761 1208 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 TAGAPQ8N103 731 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 RIPK3Q9Y572 518 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 HACD1B0YJ81 288 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 MGRN1O60291 552 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 TNFAIP8O95379 198 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 GOT1P17174 413 aa22.19■■□□□ 1.14
USP12-201ENST00000282344 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms