RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fcer2P20693 331 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 CblP22682 913 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cdh8P97291 799 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cyp2c65Q148B1 490 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pdp2Q504M2 532 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hdac7Q8C2B3 938 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Btbd6Q8K2J9 488 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Onecut3Q8K557 490 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hdac11Q91WA3 347 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tceal1Q921P9 165 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tex19.1Q99MV2 351 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ska1Q9CPV1 254 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Asb11Q9CQ31 323 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vps28Q9D1C8 221 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 MceeQ9D1I5 178 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc40a1Q9JHI9 570 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sh3glb1Q9JK48 365 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 IkbkeQ9R0T8 717 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ap4b1Q9WV76 738 aa7.21□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Atf6F6VAN0 656 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 AlpiF8VPQ6 554 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm8298J3QPI0 401 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Foxm1O08696 760 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 PdgfraP26618 1089 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gjb1P28230 283 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gabpb1Q00420 383 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 IdsQ08890 552 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scarf1Q5ND28 820 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pacsin1Q61644 441 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itih3Q61704 889 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scube3Q66PY1 993 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem270Q6UJB9 264 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ntrk3Q6VNS1 825 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q8BGA7 448 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 MtrrQ8C1A3 696 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stx19Q8R1Q0 292 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Acsf2Q8VCW8 615 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rwdd4Q9CPR1 188 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Wnt8bQ9WUD6 350 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm29554A0A087WNW4 188 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 MipepA6H611 711 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 PtproE9Q612 1226 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pcdh9F8VPK8 1237 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Aff1O88573 1216 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 PargO88622 969 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lsp1P19973 330 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Oaz1P54369 227 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Adamts10P58459 1104 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Inf2Q0GNC1 1273 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prr18Q6PAN7 307 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mcph1Q7TT79 822 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rcn2Q8BP92 320 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Heatr3Q8BQM4 679 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Haus3Q8QZX2 570 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1353Q8VGU8 309 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stk33Q924X7 491 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Homer3Q99JP6 356 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 FopnlQ9CZS3 174 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Satl1Q9D5N8 744 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 ParvbQ9ES46 365 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Actl7aQ9QY84 440 aa7.21□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ptchd4B9EKX1 904 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm4450E9Q007 373 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Calhm3J3QMI4 347 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r67K7N6T2 851 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Eno1P17182 434 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hk1P17710 974 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 TankP70347 448 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 PrkczQ02956 592 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 GsapQ3TCV3 858 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrgprx2Q3UG50 352 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam129aQ3UW53 926 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp956Q3UZY6 572 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfm4Q3UZZ4 505 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hsd3b4Q61767 373 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 SugctQ7TNE1 436 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stk38lQ7TSE6 464 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mtmr12Q80TA6 747 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Chmp2bQ8BJF9 213 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Grsf1Q8C5Q4 479 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Btbd9Q8C726 612 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 PdgfcQ8CI19 345 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmprss4Q8VCA5 435 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr345Q8VGK4 311 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Setd7Q8VHL1 366 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mtif3Q9CZD5 276 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nt5c3aQ9D020 331 aa7.2□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms