RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 UBA3Q8TBC4 463 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 WBP2Q969T9 261 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 P2RY11Q96G91 374 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LOXL4Q96JB6 756 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PNKPQ96T60 521 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RNF38Q9H0F5 515 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NMUR1Q9HB89 426 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 IL37Q9NZH6 218 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NENFQ9UMX5 172 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.16□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CFAP54Q96N23 3096 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FAM92AA1XBS5 289 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PIK3R2O00459 728 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 COCHO43405 550 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GFPT2O94808 682 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 EPN2O95208 641 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 KAT7O95251 611 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CAVIN2O95810 425 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SERPINC1P01008 464 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MMEP08473 750 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PAEPP09466 180 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF806P0C7X5 589 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FAM200BP0CF97 657 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TCF3P15923 654 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RHOQP17081 205 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 OPRD1P41143 372 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GPD2P43304 727 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SLC6A11P48066 632 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SLC5A3P53794 718 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 UBASH3AP57075 661 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MAP3K7CLP57077 242 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FMO1Q01740 532 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GAD2Q05329 585 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PTP4A2Q12974 167 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PLK5Q496M5 336 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 C2CD6Q53TS8 623 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RAB41Q5JT25 222 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 EOGTQ5NDL2 527 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RNF43Q68DV7 783 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TRNP1Q6NT89 227 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PMF1Q6P1K2 205 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SCD5Q86SK9 330 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PIGZQ86VD9 579 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PASD1Q8IV76 773 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NAT16Q8N8M0 369 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 USP33Q8TEY7 942 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 STK32AQ8WU08 396 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SPACA7Q96KW9 195 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 EDEM2Q9BV94 578 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 STK33Q9BYT3 514 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 VPS45Q9NRW7 570 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GMIPQ9P107 970 aa6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms