RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYB561D2O14569 222 aa9.9□□□□□ -0.82
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IGHV3-54-201ENST00000622166 STRNO43815 780 aa9.9□□□□□ -0.82
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IGHV3-54-201ENST00000622166 KRT36O76013 467 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAP3K6O95382 1288 aa9.9□□□□□ -0.82
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IGHV3-54-201ENST00000622166 ADORA2BP29275 332 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NOS2P35228 1153 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GJA5P36382 358 aa9.9□□□□□ -0.82
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SNAPC2Q13487 334 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TUBB3Q13509 450 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDK1Q15118 436 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 RCN1Q15293 331 aa9.9□□□□□ -0.82
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IGHV3-54-201ENST00000622166 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MROH9Q5TGP6 573 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 DEFB106AQ8N104 65 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDKL2Q92772 493 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ISL2Q96A47 359 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NPY6RQ99463 290 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 C1orf21Q9H246 121 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPAMQ9HCL2 828 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GJD2Q9UKL4 321 aa9.9□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.9□□□□□ -0.82
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TM7SF2O76062 418 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 RECQL4O94761 1208 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLHL2O95198 593 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PROCP04070 461 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SERPINE1P05121 402 aa9.89□□□□□ -0.83
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IGHV3-54-201ENST00000622166 MYL4P12829 197 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMPD1P17405 629 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 AOC1P19801 751 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRK2P25098 689 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 LMO2P25791 158 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 MGAT1P26572 445 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 HCAR3P49019 387 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAF6P49848 677 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SULT1E1P49888 294 aa9.89□□□□□ -0.83
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IGHV3-54-201ENST00000622166 DPYSQ14117 519 aa9.89□□□□□ -0.83
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IGHV3-54-201ENST00000622166 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC6Q16204 474 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 DGKDQ16760 1214 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIZQ2M2Z5 673 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SV2CQ496J9 727 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRTP1Q5TC63 336 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 IRGCQ6NXR0 463 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 OSTM1Q86WC4 334 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF139Q8WU17 664 aa9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.89□□□□□ -0.83
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