RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621161.4

RAB11FIP4-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 8,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CLN6Q9NWW5 311 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CDK8P49336 464 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 REPS1Q96D71 796 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PKN1Q16512 942 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RGS14O43566 566 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CHST12Q9NRB3 414 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SNAP23O00161 211 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FGFR2P21802 821 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CACNB3P54284 484 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PDIA6Q15084 440 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AGKQ53H12 422 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PTCH1Q13635 1447 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 A0A1W2PQ72 361 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CAPGP40121 348 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NFIAQ12857 509 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PTGISQ16647 500 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NAT9Q9BTE0 207 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UBP1Q9NZI7 540 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CRTAMO95727 393 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ADORA1P30542 326 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MTAPQ13126 283 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KCNB1Q14721 858 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FAM171BQ6P995 826 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 REEP1Q9H902 201 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SERPINA1P01009 418 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BRINP3Q76B58 766 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 O00370 1275 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NOL4O94818 638 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TPBGLP0DKB5 382 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NCOA4Q13772 614 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BTBD9Q96Q07 612 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ERP44Q9BS26 406 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 A0A088AWK7 358 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IL18RAPO95256 599 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HALP42357 657 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NR1D2Q14995 579 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 H7C1W4 665 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IRAK1P51617 712 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SEC24AO95486 1093 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DHFR2Q86XF0 187 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GPR15P49685 360 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ACTR8Q9H981 624 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC11A2P49281 568 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PRKAA1Q13131 559 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MYBPC3Q14896 1274 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms