RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 EDEM1Q92611 657 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 PADI4Q9UM07 663 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF286BP0CG31 522 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf18Q8NEA5 215 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ARMCX1Q9P291 453 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FAM86B1E9PN63 330 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 RAD23AP54725 363 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 PPATQ06203 517 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FAAP100Q0VG06 881 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 PRR23AA6NEV1 266 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 KATNA1O75449 491 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SCNN1BP51168 640 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2A2P52657 109 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 PEX1O43933 1283 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MROH8Q9H579 483 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ITSN1Q15811 1721 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 NR2C2P49116 596 aa21.81■■□□□ 1.08
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