RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.47□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-212ENST00000567690 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C1QTNF9P0C862 333 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R2P41236 205 aa7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CNGA2Q16280 664 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LHX5Q9H2C1 402 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC32A1Q9H598 525 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.46□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 E5RJQ4 531 aa7.45□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 GNA15P30679 374 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CDH18Q13634 790 aa7.45□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHSY1Q86X52 802 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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