RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555616.5

ACTN1-215, Transcript of actinin alpha 1, human

TSL 3

Gene ACTN1, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN1-215	ENST00000555616	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	MIS12	Q9H081	205 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	DEC1	Q9P2X7	70 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	NCDN	Q9UBB6	729 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	EBF1	Q9UH73	591 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	INTU	Q9ULD6	942 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC12A8	A0AV02	714 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	ANTXRL	A6NF34	631 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	LATS1	O95835	1130 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CALB1	P05937	261 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	MYBL1	P10243	752 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	LCP1	P13796	627 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	TYR	P14679	529 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	C2orf27A	Q580R0	203 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	FYB2	Q5VWT5	728 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CPXM2	Q8N436	756 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	ALLC	Q8N6M5	410 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	RNF139	Q8WU17	664 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	GAB3	Q8WWW8	586 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	EDEM1	Q92611	657 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	P2RY11	Q96G91	374 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	HINFP	Q9BQA5	517 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	RAB23	Q9ULC3	237 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	MYH10	P35580	1976 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	SGK1	O00141	431 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	GFRA2	O00451	464 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	TRIM24	O15164	1050 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	AXIN1	O15169	862 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	KRT86	O43790	486 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	IGLV3-27	P01718	113 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	LTF	P02788	710 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	RET	P07949	1114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	HMBS	P08397	361 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	ABCB4	P21439	1286 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	MMP8	P22894	467 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CHKA	P35790	457 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	ACADSB	P45954	432 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	DGKE	P52429	567 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	GALC	P54803	685 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	RING1	Q06587	406 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	PDCL	Q13371	301 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CRY1	Q16526	586 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	BEND5	Q7L4P6	421 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	ERICH1	Q86X53	443 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	DENND1C	Q8IV53	801 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	DCLK2	Q8N568	766 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	NAT16	Q8N8M0	369 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	GOLGA1	Q92805	767 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACTN1-215	ENST00000555616	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81

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