RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GBP6	Q6ZN66	633 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SNX19	Q92543	992 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FOXJ1	Q92949	421 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TATDN2	Q93075	761 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PCED1B	Q96HM7	432 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CDC6	Q99741	560 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SDCBP2	Q9H190	292 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PLK2	Q9NYY3	685 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ATM	Q13315	3056 aa		14.5	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	LGALS16	A8MUM7	142 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	METTL12	A8MUP2	240 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222		H0Y8X5	98 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FLRT2	O43155	660 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TNFSF14	O43557	240 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CLSTN1	O94985	981 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CER1	O95813	267 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TPM2	P07951	284 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	MAGEA11	P43364	429 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TPMT	P51580	245 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CDH8	P55286	799 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TPM4	P67936	248 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SPATA17	Q96L03	361 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	NT5C1B	Q96P26	610 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CLMP	Q9H6B4	373 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		14.49	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TBX18	O95935	607 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ZNF883	P0CG24	379 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	JUP	P14923	745 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SLC9A1	P19634	815 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PON1	P27169	355 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PCSK1	P29120	753 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TLE3	Q04726	772 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	INCA1	Q0VD86	236 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	LRMP	Q12912	555 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CUL2	Q13617	745 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SNX25	Q9H3E2	840 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		14.48	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	KNL1	Q8NG31	2342 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	E2F8	A0AVK6	867 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GREM1	O60565	184 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CISD3	P0C7P0	127 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TYR	P14679	529 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ANXA13	P27216	316 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	IL12RB1	P42701	662 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	KCNMA1	Q12791	1236 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SDE2	Q6IQ49	451 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	KCNK16	Q96T55	309 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	BBS2	Q9BXC9	721 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TRIM4	Q9C037	500 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SIX2	Q9NPC8	291 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CDH9	Q9ULB4	789 aa		14.47	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222		A8MXQ7	604 aa		14.46	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	CAPN9	O14815	690 aa		14.46	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	PDE6C	P51160	858 aa		14.46	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	FANCC	Q00597	558 aa		14.46	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	GCNT1	Q02742	428 aa		14.46	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	KCNC4	Q03721	635 aa		14.46	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	14.46	□□□□□ -0.09
CS-231	ENST00000552222	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		14.46	□□□□□ -0.09

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