RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PDK3Q15120 406 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 HDAC11Q96DB2 347 aa6.21□□□□□ -1.42
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