RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511595.5

FAM53C-209, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 3

Gene FAM53C, Length 551 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-209	ENST00000511595	PBX1	P40424	430 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	DGKQ	P52824	942 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	MTAP	Q13126	283 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	FHL3	Q13643	280 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	STARD3	Q14849	445 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	ACOX1	Q15067	660 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	P3H1	Q32P28	736 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	GDF15	Q99988	308 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC28A2	O43868	658 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	PLA2G6	O60733	806 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	EPN2	O95208	641 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	CD63	P08962	238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SERPINB3	P29508	390 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	GALNS	P34059	522 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	PPM1A	P35813	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	GSTM5	P46439	218 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	BFSP2	Q13515	415 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	RAB30	Q15771	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	WDR24	Q96S15	920 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	IDUA	P35475	653 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	HTR3A	P46098	478 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM53C-209	ENST00000511595	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595		A0A0G2JK05	382 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595		J3KTA2	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	ATG13	O75143	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	NDUFB8	O95169	186 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	JAK3	P52333	1124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	GGT6	Q6P531	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms