RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	FMO6P	O60774	539 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PEX11A	O75192	247 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL2	O95198	593 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TDP2	O95551	362 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CRTAM	O95727	393 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHA2	P01877	340 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ASGR2	P07307	311 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	QDPR	P09417	244 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MPST	P25325	297 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF165	P49910	485 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINB8	P50452	374 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CASP5	P51878	434 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NRL	P54845	237 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FKBP1B	P68106	108 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNAB2	Q13303	367 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PPIL2	Q13356	520 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PLCL1	Q15111	1095 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM240	Q5SV17	173 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NEPRO	Q6NW34	567 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	LBX2	Q6XYB7	198 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CPA6	Q8N4T0	437 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MB21D1	Q8N884	522 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MLKL	Q8NB16	471 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC9A6	Q92581	669 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HAS1	Q92839	578 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PEX13	Q92968	403 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PAGE5	Q96GU1	130 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	LRGUK	Q96M69	825 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CMTM3	Q96MX0	182 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC1	Q99614	292 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM2	Q9C040	744 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DRC3	Q9H069	523 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CARD9	Q9H257	536 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	THAP9	Q9H5L6	903 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TASP1	Q9H6P5	420 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FNIP2	Q9P278	1114 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMCO1	Q9UM00	188 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP8B3	O60423	1300 aa		7	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0G2JMZ2	1700 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	IRAK2	O43187	625 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ACSL4	O60488	711 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FGF18	O76093	207 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CFB	P00751	764 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	LTF	P02788	710 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HRG	P04196	525 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CLTA	P09496	248 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ANXA8	P13928	327 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	BMI1	P35226	326 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTN2	P35609	894 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	STAT6	P42226	847 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TXK	P42681	527 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SCNN1G	P51170	649 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ARSD	P51689	593 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	THOP1	P52888	689 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGCS2	P54868	508 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SNAP25	P60880	206 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTR1A	P61163	376 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NKX3-2	P78367	333 aa		6.99	□□□□□ -1.29

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