RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496840.1

TARDBP-210, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene TARDBP, Length 692 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-210ENST00000496840 CCDC138Q96M89 665 aa6.81□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.81□□□□□ -1.32
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TARDBP-210ENST00000496840 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.81□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.81□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 CEP83Q9Y592 693 aa6.81□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 TRIM38O00635 465 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 PLA2G6O60733 806 aa6.8□□□□□ -1.32
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TARDBP-210ENST00000496840 PICALMQ13492 652 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 C16orf89Q6UX73 402 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 NPIPB3Q92617 1050 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 STK33Q9BYT3 514 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 CERS4Q9HA82 394 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.8□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.79□□□□□ -1.32
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TARDBP-210ENST00000496840 TAF5LO75529 589 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 AKR1A1P14550 325 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 SCP2P22307 547 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 FAR2Q96K12 515 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 EBF3Q9H4W6 596 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.79□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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TARDBP-210ENST00000496840 PCDH17O14917 1159 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 DEPTORQ8TB45 409 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 MYD88Q99836 296 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.78□□□□□ -1.32
TARDBP-210ENST00000496840 CD8B2A6NJW9 211 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 FGF2P09038 288 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 SNHG28P0DPA3 235 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 TNFRSF1BP20333 461 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 IL31Q6EBC2 164 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 DHRS13Q6UX07 377 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 FAM47BQ8NA70 645 aa6.77□□□□□ -1.33
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TARDBP-210ENST00000496840 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.77□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 H3BNX3 289 aa6.76□□□□□ -1.33
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TARDBP-210ENST00000496840 PPP6R2O75170 966 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 ANXA6P08133 673 aa6.76□□□□□ -1.33
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TARDBP-210ENST00000496840 TBX4P57082 545 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 MIDNQ504T8 468 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 LIPMQ5VYY2 423 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 WDR93Q6P2C0 686 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 KIAA1191Q96A73 305 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 TNIP3Q96KP6 325 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.76□□□□□ -1.33
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TARDBP-210ENST00000496840 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.76□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.76□□□□□ -1.33
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TARDBP-210ENST00000496840 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 A0A0G2JK05 382 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 B4DGG1 531 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 IKBKBO14920 756 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 UGDHO60701 494 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 NPPBP16860 134 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 BTKQ06187 659 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 GRM4Q14833 912 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 AAK1Q2M2I8 961 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 MANEAQ5SRI9 462 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.75□□□□□ -1.33
TARDBP-210ENST00000496840 TRABD2AQ86V40 505 aa6.75□□□□□ -1.33
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