RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 B4DGG1 531 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 J3KTA2 159 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 FGF18O76093 207 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 STAT6P42226 847 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.644e-7■□□□□ 10.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 MANEAQ5SRI9 462 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 CERS4Q9HA82 394 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 EMSYQ7Z589 1322 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 ANO9A1A5B4 782 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 CD8B2A6NJW9 211 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 RASA4BC9J798 803 aa4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 RASA4O43374 803 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNAB3O43448 404 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 AKR1A1P14550 325 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 GNALP38405 381 aa4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 PICALMQ13492 652 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC181Q5TID7 509 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 LIPMQ5VYY2 423 aa4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 P2RY11Q96G91 374 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC138Q96M89 665 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 AK2P54819 239 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 RFX6Q8HWS3 928 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 DECR2Q9NUI1 292 aa4.79□□□□□ -1.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 PEG3Q9GZU2 1588 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 ERCC6Q03468 1493 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 DPPA5A6NC42 116 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGA5P08648 1049 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 SOX2P48431 317 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00205P59089 165 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-210ENST00000485459 DMWDQ09019 674 aa4.78□□□□□ -1.64
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