RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	RPS6KB1	P23443	525 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	SOX2	P48431	317 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	RHBDL3	P58872	404 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	MORC3	Q14149	939 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PFKFB4	Q16877	469 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	AAK1	Q2M2I8	961 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	ZACN	Q401N2	412 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM60	Q495X7	471 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	RSC1A1	Q92681	617 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PMM1	Q92871	262 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	CUL5	Q93034	780 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	NFU1	Q9UMS0	254 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	SMARCA4	P51532	1647 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	MOSPD3	O75425	235 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ST6GAL1	P15907	406 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	AKT1	P31749	480 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	MMP13	P45452	471 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	LIN54	Q6MZP7	749 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	GGT6	Q6P531	493 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	PIGK	Q92643	395 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	KIF28P	B7ZC32	967 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	TLR2	O60603	784 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	KAT7	O95251	611 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	CTSA	P10619	480 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SERPINF1	P36955	418 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ID2	Q02363	134 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	TLE3	Q04726	772 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ICA1	Q05084	483 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF91	Q05481	1191 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	MTA1	Q13330	715 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	WDR93	Q6P2C0	686 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	POF1B	Q8WVV4	589 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	GPR78	Q96P69	363 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	RMDN3	Q96TC7	470 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	CUX2	O14529	1486 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ACKR2	O00590	384 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	PPEF2	O14830	753 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	PPP6R2	O75170	966 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SGPL1	O95470	568 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	IGFBP2	P18065	325 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	LMO1	P25800	156 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	FOXL2	P58012	376 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	TAS2R50	P59544	299 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	PIP4P1	Q86T03	277 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	MECR	Q9BV79	373 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM2	Q9C040	744 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ERCC6	Q03468	1493 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	EMSY	Q7Z589	1322 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NFU1-209	ENST00000474230	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		5.68	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms