RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971		H7C0C1	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CLDN5	O00501	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NRP1	O14786	923 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TP73	O15350	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KCNN4	O15554	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HCRT	O43612	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OPHN1	O60890	802 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NBN	O60934	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CDH16	O75309	829 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GCAT	O75600	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DDHD2	O94830	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CD48	P09326	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MLN	P12872	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCL5	P13501	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TPSB2	P20231	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IGFBP4	P22692	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BDNF	P23560	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IL4R	P24394	825 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ADRA1B	P35368	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FDFT1	P37268	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GRIK1	P39086	918 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MAGEA4	P43358	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BRCC3	P46736	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ATP5O	P48047	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GLUD2	P49448	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CXCR3	P49682	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TPI1	P60174	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	COG7	P83436	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CREM	Q03060	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NME3	Q13232	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IKBKE	Q14164	716 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TAF5	Q15542	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MCU	Q8NE86	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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