RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	RFX3	P48380	749 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	LPIN1	Q14693	890 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CDH18	Q13634	790 aa		13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NR1D2	Q14995	579 aa		13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285		Q4G0T1	1027 aa		13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NACC2	Q96BF6	587 aa		13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.65	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PLA2G6	O60733	806 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	HOXC8	P31273	242 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC1A6	P48664	564 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285		E9PCH4	1651 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285		A0A087X0T9	212 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	AP1G2	O75843	785 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23	2e-6	■■■■□ 20.8
NCOR2-208	ENST00000429285	NR6A1	Q15406	480 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TAF13	Q15543	124 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CROT	Q9UKG9	612 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SIX5	Q8N196	739 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ME2	P23368	584 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CAPG	P40121	348 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FGR	P09769	529 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RGS7	P49802	495 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	PTEN	P60484	403 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	IER5	Q5VY09	327 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	REEP1	Q9H902	201 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	VPS51	Q9UID3	782 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNA6	P17658	529 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	MCAM	P43121	646 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23	4e-7	■■■■■ 30.6
NCOR2-208	ENST00000429285	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ZW10	O43264	779 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	UBOX5	O94941	541 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SERPINE1	P05121	402 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RAG1	P15918	1043 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	ATP4A	P20648	1035 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC11A2	P49281	568 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	STK4	Q13043	487 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	CBFB	Q13951	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NCOR2-208	ENST00000429285	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23	2e-6	■■■■■ 37.5
NCOR2-208	ENST00000429285	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.63	□□□□□ -0.23

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