RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 HSD3B1P14060 373 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 MATN1P21941 496 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 SERPINA4P29622 427 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 RILPL2Q969X0 211 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 SNX18Q96RF0 628 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
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