RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 NUMBP49757 651 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 UNC93AQ86WB7 457 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 THAP1Q9NVV9 213 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 A0A096LPK6 155 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 MGAT1P26572 445 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF844Q08AG5 666 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RIN3Q8TB24 985 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CDCA5Q96FF9 252 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 APOPT1Q96IL0 206 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP42Q96MM3 310 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM114B3SHH9 223 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 IFNA14P01570 189 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CNBD2Q96M20 576 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SNTNA6NMZ2 147 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RECQL4O94761 1208 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2BQ00403 316 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 UBE3AQ05086 875 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ADRM1Q16186 407 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 KYQ8NBH2 561 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 HAS1Q92839 578 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PARVBQ9HBI1 364 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 LZTS1Q9Y250 596 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 AP4S1Q9Y587 144 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PSMC3P17980 439 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CYP3A7P24462 503 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CAPZA2P47755 286 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 NDEL1Q9GZM8 345 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 VAPBO95292 243 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 MYL4P12829 197 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CPNE1Q99829 537 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 WDR27A2RRH5 827 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ENO4A6NNW6 628 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ADM5C9JUS6 153 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PHF21BQ96EK2 531 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT3Q9UH03 358 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 F8VP50 259 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 MEIS2O14770 477 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FCGR1AP12314 374 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RRM2P31350 389 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 AMPD2Q01433 879 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CNGA2Q16280 664 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF9O75901 435 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CCNG1P51959 295 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM32Q8TC27 787 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 HPS4Q9NQG7 708 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 BAIAP3O94812 1187 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CDK7P50613 346 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ANKS6Q68DC2 871 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 IYDQ6PHW0 289 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 GDF3Q9NR23 364 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RGS18Q9NS28 235 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 RAD23AP54725 363 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCQQ04759 706 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SENP8Q96LD8 212 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ACOX2Q99424 681 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SLC1A6P48664 564 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 NAB1Q13506 487 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 KAT5Q92993 513 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 VPS33AQ96AX1 596 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 CHST7Q9NS84 486 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms